Topological microstructure analysis of the TIP4P-EW water model

Svistunov I.N., Kolokol A.S., Shimkevich A.L.
 pdf (1722K)  / Annotation

List of references:

  1. Г. Р. Иваницкий, А. А. Деев, Е. П. Хижняк. Может ли существовать долговременная структурнодинамическая память воды? // Успехи физических наук. — 2014. — Т. 184, № 1. — С. 43–74.
  2. Г. Г. Маленков. Структура и динамика жидкой воды // Журнал структурной химии. — 2006. — Т. 47. — С. 5–35.
  3. Н.Н. Медведев. Метод Вороного–Делоне в исследовании структуры некристаллических систем. — Новосибирск: Сибирское отделение РАН, 2000. — 214 с.
  4. И. Н. Свистунов, А. С. Колокол, И. В. Пышин, А. Л. Шимкевич. Сравнительный анализ микроструктуры жидкой воды // Вопросы атомной науки и техники. Серия: Математическое моделирование физических процессов. — 2013. — № 1. — С. 74−85.
  5. J. D. Bernal. The Bakerian Lecture, 1962. The Structure of Liquids // Proceedings of the Royal Society of London. Series A, Mathematical and Physical Sciences. — 1964. — V. 280, no. 1382. — P. 299–322. — DOI: 10.1098/rspa.1964.0147. — ads: 1964RSPSA.280..299B.
  6. G. N. I. Clark, C. D. Cappa, J. D. Smith, R. J. Saykallyc, T. Head-Gordon. The structure of ambient water // Molecular Physics. — 2010. — V. 108, no. 11. — P. 1415–1433. — DOI: 10.1080/00268971003762134. — ads: 2010MolPh.108.1415C.
  7. H. W. Horn, W. C. Swope, J. W. Pitera, J. D. Madura, T. J. Dick, G. L. Hura, T. Head-Gordon. Development of an improved four-site water model for biomolecular simulations: TIP4P-Ew // Journal of Chemical Physics. — 2004. — V. 120, no. 20. — P. 9665–9678. — DOI: 10.1063/1.1683075. — ads: 2004JChPh.120.9665H.
  8. C. Huang, K. T. Wikfeldt, T. Tokushima, D. Nordlund, Y. Harada, U. Bergmann, M. Niebuhr, T. M. Weiss, Y. Horikawa, M. Leetmaa, M. P. Ljungberg, O. Takahashi, A. Lenz, L. Ojamae, A.P. Lyubartsev, S. Shin, L.G.M. Pettersson, A. Nilsson. The inhomogeneous structure of water at ambient conditions // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2009. — V. 106, no. 36. — P. 15214–15218. — DOI: 10.1073/pnas.0904743106. — ads: 2009PNAS..10615214H.
  9. A. S. Kolokol, A. L. Shimkevich. Topological structure of density fluctuations in condensed matter // Journal of Non-Crystalline Solids. — 2010. — V. 356. — P. 220−223. — DOI: 10.1016/j.jnoncrysol.2009.11.020. — ads: 2010JNCS..356..220K.
  10. S. Plimpton. Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics // Journal of Computational Physics. — 1995. — V. 117. — P. 1−19. — DOI: 10.1006/jcph.1995.1039. — ads: 1995JCoPh.117....1P.
  11. D. Swiatla-Wojcik. Evaluation of the criteria of hydrogen bonding in highly associated liquids // Chemical Physics. — 2007. — V. 342, no. 1–3. — P. 260–266. — DOI: 10.1016/j.chemphys.2007.10.009. — ads: 2007CP....342..260S.
  12. Ph. Wernet, D. Nordlund, U. Bergmann, M. Cavalleri, M. Odelius, H. Ogasawara, L. A. Näslund, T. K. Hirsch, L. Ojamäe, P. Glatzel, L. G. M. Pettersson, A. Nilsson. The Structure of the First Coordination Shell in Liquid Water // Science. — 2004. — V. 304, no. 5673. — P. 995–999. — DOI: 10.1126/science.1096205. — ads: 2004Sci...304..995W.

Indexed in Scopus

Full-text version of the journal is also available on the web site of the scientific electronic library eLIBRARY.RU

The journal is included in the Russian Science Citation Index

The journal is included in the RSCI

International Interdisciplinary Conference "Mathematics. Computing. Education"

Copyright © 2009–2024 Institute of Computer Science