Результаты поиска по 'ДНК':
Найдено статей: 33
  1. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2017, т. 9, № 5, с. 673-675
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2017, v. 9, no. 5, pp. 673-675
    Views (last year): 1.
  2. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2018, т. 10, № 4, с. 379-381
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2018, v. 10, no. 4, pp. 379-381
    Views (last year): 36.
  3. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2018, т. 10, № 6, с. 733-735
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2018, v. 10, no. 6, pp. 733-735
    Views (last year): 20.
  4. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2019, т. 11, № 3, с. 363-365
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2019, v. 11, no. 3, pp. 363-365
    Views (last year): 20.
  5. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2020, т. 12, № 2, с. 259-261
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2020, v. 12, no. 2, pp. 259-261
  6. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2020, т. 12, № 6, с. 1261-1264
    Editor's note
    Computer Research and Modeling, 2020, v. 12, no. 6, pp. 1261-1264
  7. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2021, т. 13, № 6, с. 1097-1100
    Editor’s note
    Computer Research and Modeling, 2021, v. 13, no. 6, pp. 1097-1100
  8. От редакции
    Компьютерные исследования и моделирование, 2024, т. 16, № 2, с. 245-248
    Editor’s note
    Computer Research and Modeling, 2024, v. 16, no. 2, pp. 245-248
  9. Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г.
    Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК
    Компьютерные исследования и моделирование, 2009, т. 1, № 3, с. 281-286

    С помощью разбиения Вороного–Делоне определены контакты между белками и нуклеиновыми кислотами в комплексах белок-ДНК. Показано, что приблизительно треть всех контактов составляют контакты с положительно заряженными аминокислотами Arg и Lys, 32,3 %. Ser и Thr дают в сумме следующий по величине вклад - 15 %. Asn образует 6 % контактов, также как и Gly. Вклад каждой из остальных аминокислот не превышает 5 %. Установлено, что статистически значимыми являются контакты типа Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C и His-T. Предложен общий механизм участия отрицательно заряженных остатков в специфических взаимодействиях белок-ДНК.

    Ключевые слова: разбиение Вороного–Делоне, комплексы белок-ДНК.
    Anashkina A.A., Esipova N.G., Kuznetsov E.N., Tumanyan V.G.
    Contact specificity in protein-DNA complexes
    Computer Research and Modeling, 2009, v. 1, no. 3, pp. 281-286

    In this work we investigated contacts between proteins and nucleic acids by Voronoi-Delaunay tessellation. About one third of all contacts are contacts between nucleotides and positively charged residues Arg and Lys, 32,3 %. Ser and Thr together take part in 15 % of contacts. Asn forms 6 % of contacts, as well as Gly. Contribution of each other residue type does not exceed 5 %. Statistically significant are contacts Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C and His-T. General mechanism of charged residues participation in specific protein-DNA interac-tions is suggested.

    Keywords: Voronoi–Delaunay tessellation, protein-DNA complexes.
    Views (last year): 2.
  10. Головкин М.В., Нечипуренко Д.Ю., Ильичева И.А., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Гроховский С.Л., Нечипуренко Ю.Д.
    [СТАТЬЯ РЕТРАГИРОВАНА] Математические методы анализа электрофоретических картин расщепления ДНК
    Компьютерные исследования и моделирование, 2009, т. 1, № 3, с. 287-295

    Статья была ретрагирована 3 мая 2022 года по просьбе авторов в связи с тем, что включенные в статью данные были опубликованы в статье Нечипуренко Ю.Д., Головкин М.В., Нечипуренко Д.Ю., Ильичева И.А., Панченко Л.А., Полозов Р.В., Гроховский С.Л. Характерные особенности расщепления ДНК ультразвуком. Журнал структурной химии, 2009, том 50, номер 5, страницы 1045-1052.

    Golovkin M.V., Nechipurenko D.Y., Il’icheva I.A., Panchenko L.A., Polozov R.V., Grokhovsky S.L., Nechipurenko Y.D.
    [RETRACTED PAPER] Calculational methods for electrophoretic cleavage pattern analysis of DNA
    Computer Research and Modeling, 2009, v. 1, no. 3, pp. 287-295

    The article was retracted on May 3, 2022 at the request of the authors due to the fact that the data included in the article were published in the article by Nechipurenko Y.D., Golovkin M.V., Nechipurenko D.Yu., Ilyicheva I.A., Panchenko L. .A., Polozov R.V., Grokhovsky S.L. Kharakternye osobennosti rasshchepleniya DNK ul'trazvukom [Characteristic features of DNA cleavage by ultrasound]. Journal of Structural Chemistry, 2009, volume 50, number 5, pages 1045-1052 (in Russian).

    Views (last year): 3. Citations: 1 (RSCI).
Pages: next last »

Indexed in Scopus

Full-text version of the journal is also available on the web site of the scientific electronic library eLIBRARY.RU

The journal is included in the Russian Science Citation Index

The journal is included in the RSCI

International Interdisciplinary Conference "Mathematics. Computing. Education"

Copyright © 2009–2024 Institute of Computer Science