Результаты поиска по 'С-кадгерин':
Найдено статей: 1
  1. Лихачев И.В., Галзитская О.В., Балабаев Н.К.
    Исследование механических свойств C-кадгерина методом молекулярной динамики
    Компьютерные исследования и моделирование, 2013, т. 5, № 4, с. 727-735

    В настоящей работе исследуется механическая стабильность белка клеточной адгезии, кадгерина, методом молекулярной динамики с использованием явной модели растворителя. Было проведено моделирование разворачивания белка за концы с постоянной скоростью для апоформы белка и при наличии в ней ионов разных типов (Ca2+, Mg2+, Na+, K+). Было выполнено по 8 независимых вычислительных экспериментов для каждой формы белка и показано, что одновалентные ионы меньше стабилизируют структуру, чем двухвалентные при механическом разворачивании молекулы кадгерина за концы. Модельная система из двух аминокислот и иона металла между ними в опытах по растяжению демонстрирует свойства аналогичные поведению кадгерина: cистемы с ионами калия и натрия обладают меньшей механической стабильностью на внешнее силовое воздействие в сравнении с системами с кальцием и магнием.

    Ключевые слова: С-кадгерин, молекулярная динамика, двухвалентные и одновалентные ионы.
    Lihachev I.V., Galzitskaya O.V., Balabaev N.K.
    Investigation of C-Cadherin mechanical properties by Molecular Dynamics
    Computer Research and Modeling, 2013, v. 5, no. 4, pp. 727-735

    The mechanical stability of cell adhesion protein Cadherin with explicit model of water is studied by the method of molecular dynamics. The protein in apo-form and with the ions of different types (Ca2+, Mg2+, Na+, K+) was unfolding with a constant speed by applying the force to the ends. Eight independent experiments were done for each form of the protein. It was shown that univalent ions stabilize the structure less than bivalent one under mechanical unfolding of the protein. A model system composed of two amino acids and the metal ion between them demonstrates properties similar to that of the cadherin in the stretching experiments. The systems with potassium and sodium ions have less mechanical stability then the systems with calcium and magnesium ions.

    Keywords: C-Cadherin, molecular dynamics, bivalent and univalent ions.
    Views (last year): 5.

Indexed in Scopus

Full-text version of the journal is also available on the web site of the scientific electronic library eLIBRARY.RU

The journal is included in the Russian Science Citation Index

The journal is included in the RSCI

International Interdisciplinary Conference "Mathematics. Computing. Education"

Copyright © 2009–2024 Institute of Computer Science