All issues
- 2026 Vol. 18
- 2025 Vol. 17
- 2024 Vol. 16
- 2023 Vol. 15
- 2022 Vol. 14
- 2021 Vol. 13
- 2020 Vol. 12
- 2019 Vol. 11
- 2018 Vol. 10
- 2017 Vol. 9
- 2016 Vol. 8
- 2015 Vol. 7
- 2014 Vol. 6
- 2013 Vol. 5
- 2012 Vol. 4
- 2011 Vol. 3
- 2010 Vol. 2
- 2009 Vol. 1
-
Математическая модель свертывания крови в воротной вене
Компьютерные исследования и моделирование, 2026, т. 18, № 3, с. 561-587Тромбоз воротной вены (ТВВ) является значимым осложнением как в претрансплантационном, так и в послеоперационном периоде трансплантации печени. Многофакторная этиология ТВВ, парадоксальное состояние гемостаза при циррозе печени и ограниченная информативность стандартных коагулологических тестов определяют необходимость разработки формализованных моделей для оценки риска тромбообразования.
Цель работы — на основе математической модели системы свертывания крови исследовать влияние гидродинамических условий и уровней факторов коагуляции на возможность формирования тромба в воротной вене.
Воротная вена рассматривается как проточный реактор с быстрым конвективным перемешиванием. Математическая модель основана на детализированной кинетической схеме, включающей уравнения для внешнего пути активации свертывания, петель положительных и отрицательной обратных связей, ингибирования активных факторов. Система обыкновенных дифференциальных уравнений интегрировалась одностадийным методом Розенброка с комплексными коэффициентами.
Показан пороговый характер генерации тромбина в зависимости от скорости кровотока. При превышении критической скорости фаза инициации не переходит в фазу амплификации, что соответствует физиологическим условиям, препятствующим тромбообразованию. Продемонстрировано, что при пониженной концентрации фибриногена (характерной для дисфункции печени) порог скорости, выше которого тромб не формируется, возрастает, что означает повышенную чувствительность системы к стазу. Дефицит протеина C в моделируемых условиях оказывает минимальное влияние на динамику тромбообразования. Результаты моделирования качественно согласуются с клиническими данными по распределению пациентов с ТВВ по уровню фибриногена ($n$ = 932, НИИ им. Склифосовского).
Математическое моделирование позволяет формализовать связь между гемодинамическими и биохимическими факторами риска ТВВ. Пониженный уровень фибриногена идентифицирован как фактор, усиливающий тромботический потенциал при условиях стаза. Полученные результаты открывают перспективы для пациент-ориентированного прогнозирования риска ТВВ у кандидатов на трансплантацию печени.
Ключевые слова: система свертывания крови, производство тромбина, проточный реактор, воротная вена, венозный тромбоз.
Mathematical model of blood clotting in the portal vein
Computer Research and Modeling, 2026, v. 18, no. 3, pp. 561-587Portal vein thrombosis (PVT) is a significant complication during both the pre-transplant and postoperative periods of liver transplantation. The multifactorial etiology of PVT, the paradoxical hemostatic state in liver cirrhosis and the limited usefulness of standard coagulation tests highlight the necessity of formalized models to assess thrombosis risk.
Objective: Using a mathematical model of the blood coagulation system, investigate the influence of hemodynamic conditions and coagulation factor levels on the likelihood of thrombus formation in the portal vein.
The portal vein is modelled as a flow-through reactor with rapid convective mixing. The mathematical model is based on Panteleev et al. (2010) detailed kinetic scheme, incorporating equations for the extrinsic pathway of coagulation activation, positive and negative feedback loops, and inhibition of active factors. The resulting system of ordinary differential equations was integrated using a one-stage Rosenbrock method with complex coefficients.
Thrombin generation was shown to exhibit threshold dependence on blood flow velocity. Above a critical velocity, the initiation phase does not transition to the amplification phase. This corresponds to physiological conditions that prevent thrombus formation. We demonstrated that, at reduced fibrinogen concentrations characteristic of hepatic dysfunction, the critical velocity threshold above which thrombus formation is suppressed increases. This indicates the system’s heightened susceptibility to stasis. Protein C deficiency had minimal effect on thrombogenesis dynamics under the modeled conditions. The modeling results qualitatively agree with clinical data on fibrinogen distribution in PVT patients ($n$ = 932, Sklifosovsky Research Institute).
-
LD-фильтр для оценки состояния парных марковских моделей
Компьютерные исследования и моделирование, 2026, т. 18, № 4, с. 747-764В работе рассматривается задача оценивания состояния парных марковских моделей с гауссовыми шумами. Класс парных марковских моделей является обобщением класса классических скрытых марковских моделей. Ключевое отличие заключается в том, что марковским предполагается не скрытый процесс, а пара «состояние – наблюдение», что позволяет моделировать более сложные зависимости и, в частности, отказаться от требования марковости скрытого процесса. При этом для линейных гауссовских парных моделей сохраняется возможность применения методов калмановской фильтрации, что приводит к понятию парного фильтра Калмана.
Представлена новая модификация парного фильтра Калмана, основанная на применении модифицированной взвешенной ортогонализации Грама–Шмидта и LD-разложении ковариационных матриц. Основными результатами данной работы являются: новая LD-модификация парного фильтра Калмана (теорема 1); новый алгоритм LD-ПФК для оценки состояния парных марковских моделей на основе прямой процедуры модифицированной взвешенной ортогонализации Грама–Шмидта и LD-разложения ковариационных матриц (алгоритм 2); результаты сравнительного анализа вычислительных свойств алгоритмов парной фильтрации. Полученные теоретические результаты дополняют теорию парной фильтрации в классе линейных дискретных парных марковских моделей с гауссовыми шумами.
Разработанный алгоритм реализован на языке MATLAB. Проведены серии численных экспериментов, результаты которых демонстрируют его работоспособность и численные преимущества перед другими существующими модификациями парного фильтра Калмана.
Представленные результаты могут быть в дальнейшем использованы для построения новых методов параметрической идентификации парных марковских моделей.
Ключевые слова: парная марковская модель, парный фильтр Калмана, MWGS-ортогонализация, LD-разложение, алгоритм дискретной фильтрации.
LD filter for the state estimation of pairwise Markov models
Computer Research and Modeling, 2026, v. 18, no. 4, pp. 747-764The paper addresses the state estimation problem for pairwise Markov models with Gaussian noises. The class of pairwise Markov models generalizes the classical hidden Markov models. The key difference lies in the assumption that the Markov property holds not for the hidden process alone, but for the pair consisting of the state and the observation. This allows modeling more complex dependencies and, in particular, eliminates the requirement of Markovianity for the hidden process. For linear Gaussian pairwise models, Kalman filtering methods remain applicable, leading to the concept of the pairwise Kalman filter.
This work proposes a new modification of the pairwise Kalman filter based on the application of modified weighted Gram – Schmidt orthogonalization and the LD decomposition of covariance matrices. The main results are as follows: a novel LD modification of the pairwise Kalman filter (Theorem 1); a new LD-PKF algorithm for state estimation of pairwise Markov models, based on a direct procedure of modified weighted Gram–Schmidt orthogonalization and LD decomposition of covariance matrices (algorithm 2); results of comparative analysis on the numerical properties of pairwise discrete filtering algorithms.
The obtained theoretical results complement the theory of pairwise filtering in the class of linear discrete pairwise Markov models with Gaussian noises.
The developed algorithm is implemented in MATLAB. A series of numerical experiments are conducted, and the results demonstrate its effectiveness and numerical advantages over other existing modifications of the pairwise Kalman filter.
The presented results can be further used to develop new methods for parameter identification of pairwise Markov models.
-
Диффузионная неустойчивость в трехкомпонентной модели типа «реакция–диффузия»
Компьютерные исследования и моделирование, 2011, т. 3, № 2, с. 135-146В данной работе проведено исследование возникновения диффузионной неустойчивости в системе из трех уравнений типа «реакция–диффузия». В общем виде получены условия как тьюринговской, так и волновой неустойчивостей. Выявлены качественные свойства, которыми должна обладать система для того, чтобы в ней могла произойти та или другая бифуркация. В численных экспериментах показано, что при выполнении соответствующих условий в нелинейной модели возникают структуры, которые предсказываются линейным анализом.
Diffusion instability in a threevariable reaction–diffusion model
Computer Research and Modeling, 2011, v. 3, no. 2, pp. 135-146Views (last year): 1. Citations: 7 (RSCI).Investigation of occurrence of diffusion instability in a set of three reaction–diffusion equations is carried out. In the general case the condition for both Turing and wave instabilities are obtained. Qualitative properties of the system, in which the bifurcation of each of the two types can take place, are clarified. In numerical experiments it is shown that if the corresponding conditions are met in the nonlinear model, spatiotemporal patterns are formed, which are predicted by linear analysis.
-
О применении асимптотических критериев для определения числа компонент смеси вероятностных распределений
Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 1, с. 45-53В статье демонстрируется практическая эффективность применения асимптотически наиболее мощных критериев проверки гипотез о числе компонент смеси в моделях добавления и расщепления компонент. Тестовые данные представляют собой выборки из различных конечных смесей нормальных законов. Проводится сравнение результатов для разнообразных уровней значимости и весов.
On application of the asymptotic tests for estimating the number of mixture distribution components
Computer Research and Modeling, 2012, v. 4, no. 1, pp. 45-53Views (last year): 1. Citations: 2 (RSCI).The paper demonstrates the efficiency of asymptotically most powerful test of statistical hypotheses about the number of mixture components in the adding and splitting component models. Test data are the samples from different finite normal mixtures. The results are compared for various significance levels and weights.
-
Математическая модель и компьютерный анализ критериев однородности зависимости «доза–эффект»
Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 2, с. 267-273Данная работа посвящена сравнению двух критериев однородности: критерия χ2, основанного на таблицах сопряженности признаков 2 × 2, и критерия однородности, основанного на асимптотических распределениях суммируемых квадратичных уклонений оценок функции распределения в модели зависимости «доза–эффект». Оценка мощности критериев производится при помощи компьютерного моделирования. Для построения функций эффективности используется метод ядерной оценки регрессии, основанный на оценке Надарая–Ватсона.
Ключевые слова: модель зависимости «доза–эффект», непараметрический метод ядерной оценки регрессии, оценка Надарая–Ватсона, критерии однородности.
Mathematical model and computer analysis of tests for homogeneity of “dose–effect” dependence
Computer Research and Modeling, 2012, v. 4, no. 2, pp. 267-273Views (last year): 6.The given work is devoted to the comparison of two tests for homogeneity: chi-square test based on contingency tables of 2 × 2 and test for homogeneity based on asymptotic distributions of the summarized square error of a distribution function estimators in the model of ”dose–effect” dependence. The evaluation of test power is performed by means of computer simulation. In order to design efficiency functions the method of kernel regression estimator based on Nadaray–Watson estimator is used.
-
Регуляризация, робастность и разреженность вероятностных тематических моделей
Компьютерные исследования и моделирование, 2012, т. 4, № 4, с. 693-706Предлагается обобщенное семейство вероятностных тематических моделей коллекций текстовых документов, в котором эвристики регуляризации, сэмплирования, частого обновления параметров, робастности относительно шума и фона могут включаться независимо друг от друга в любых сочетаниях, порождая как известные модели PLSA, LDA, CVB0, SWB, так и новые. Показано, что робастная тематическая модель на основе PLSA, разделяющая термины на тематические, шумовые и фоновые, не нуждается в регуляризации и обеспечивает разреженность искомых дискретных распределений тем в документах и терминов в темах.
Ключевые слова: компьютерныйана лиз текстов, тематическое моделирование, вероятностныйла тентный семантическийана лиз, EM-алгоритм, латентное размещение Дирихле, сэмплирование Гиббса, байесовская регуляризация, перплексия, робастность.
Regularization, robustness and sparsity of probabilistic topic models
Computer Research and Modeling, 2012, v. 4, no. 4, pp. 693-706Views (last year): 25. Citations: 12 (RSCI).We propose a generalized probabilistic topic model of text corpora which can incorporate heuristics of Bayesian regularization, sampling, frequent parameters update, and robustness in any combinations. Wellknown models PLSA, LDA, CVB0, SWB, and many others can be considered as special cases of the proposed broad family of models. We propose the robust PLSA model and show that it is more sparse and performs better that regularized models like LDA.
-
Подсистема «Разработчик» системы приема коммунальных платежей
Компьютерные исследования и моделирование, 2013, т. 5, № 1, с. 25-36В работе рассматривается одна из ключевых подсистем приема коммунальных платежей «Разработчик». Описана разработанная система массового обслуживания, которая моделирует данную подсистему. Поставлена и решена задача о распределении ресурсов (в решении использовался модифицированный «венгерский» алгоритм). Приведено описание имитационной (агентной) модели данной подсистемы и результаты имитационных экспериментов.
Ключевые слова: система массового обслуживания, задача о распределении, модификация «венгерского» алгоритма, имитационное моделирование, агентная модель, имитационный эксперимент.
Subsystem “Developer” as a part of the Retail Payment System
Computer Research and Modeling, 2013, v. 5, no. 1, pp. 25-36In this paper we consider one of the core subsystems of the retail payment system named “Developer”. The Queuing System for modeling this subsystem was developed and information about it is provided. The task for the assignment problem was set up and solved (the modification of the Hungarian algorithm was used). Information about Agent Based Model for subsystem “Developer” and the results of the simulation experiments are given.
-
Построение и исследование непрерывной клеточно-автоматной модели процессов теплопроводности с фазовыми переходами первого рода
Компьютерные исследования и моделирование, 2013, т. 5, № 2, с. 141-152В данной статье рассматриваются процессы теплопроводности, сопровождающиеся фазовыми переходами первого рода. При помощи клеточно-автоматного моделирования был исследован класс задач, имеющих широкое применение в практической деятельности. В работе приведены вычисления распределения температуры по глубине почвы в разные моменты времени для задачи промерзания влажного грунта. Другая задача — зонное выращивание — также смоделирована с помощью клеточных автоматов. Совпадение реальных и модельных параметров системы подтверждает целесообразность использования выбранного способа моделирования физических процессов.
Construction and investigation of continuous cellular automatа model of heat conductivity processes with first order phase transitions
Computer Research and Modeling, 2013, v. 5, no. 2, pp. 141-152Views (last year): 2. Citations: 2 (RSCI).The process of heat conduction, accompanied by the first order phase transitions is discussed in this article. Using cellular automates simulation was investigated class of problems that have broad application in practice. In this paper we calculate the temperature distribution in the depth of the soil at different times for a problem of freezing of moist soil. Another task — zone growing — has been modeled by cellular automates too. The coincidence of real and modeling parameters of the system confirms the feasibility of using the selected method of modeling of physical processes.
-
Исследование механизмов формирования сегментированных волн в активных средах
Компьютерные исследования и моделирование, 2013, т. 5, № 4, с. 533-542В данной работе предложены три возможных механизма формирования сегментированных волн и спиралей. Структуры такого рода были обнаружены в реакции Белоусова–Жаботинского, диспергированной в обращенной микроэмульсии аэрозоля OT. Первый механизм обусловлен взаимодействием двух подсистем, одна из которых возбудима, а другая неустойчива по Тьюрингу. Показано, как под воздействием поперечной неустойчивости из однородной гладкой спиральной волны формируется сегментированная спираль. В зависимости от свойств подсистем мы демонстрируем несколько различных по виду и форме сегментированных спиральных волн. В качестве второго механизма мы предлагаем «дробление» бегущей волны в окрестности бифуркационной точки коразмерности два, в которой пересекаются границы тьюринговской и волновой неустойчивостей. Наконец, мы показываем, что сегментированные волны могут возникать в некоторых простых двухкомпонентных моделях типа «реакция–диффузия», имеющих более одного стационарного состояния, в частности, в модели ФитцХью–Нагумо.
On the mechanisms for formation of segmented waves in active media
Computer Research and Modeling, 2013, v. 5, no. 4, pp. 533-542Citations: 3 (RSCI).We suggest three possible mechanisms for formation of segmented waves and spirals. These structures were observed in the Belousov–Zhabotinsky reaction dispersed in a water-in-oil aerosol OT microemulsion. The first mechanism is caused by interaction of two coupled subsystems, one of which is excitable, and the other one has Turing instability depending on the parameters. It is shown that, segmented spirals evolve from ordinary smooth spirals as a result of the transverse Turing instability. We demonstrate that depending on the properties of subsystems different segmented spirals emerge. For the second mechanism we suggest "splitting" of the traveling wave in the vicinity of the bifurcation point of codimension-2, where the boundaries of the Turing and wave instabilities intersect. Finally we show that the segmented waves can emerge in some simple two-component reaction-diffusion models having more than one steady state, particularly in a FitzHugh–Nagumo model.
-
Формирование оптимального управления нелинейным динамическим объектом на основе модели Такаги–Сугено
Компьютерные исследования и моделирование, 2015, т. 7, № 1, с. 51-59В работе рассмотрен алгоритм нечеткой системы управления существенно нелинейным динамическим объектом. Для решения нелинейной задачи оптимального управления предлагается использовать линейно-квадратичное регулирование (LQR — linear quadratic regulator) с моделью Такаги–Сугено (Takagi–Sugeno). Алгоритм может быть использован для проектирования систем оптимального управления детерминированными нелинейными объектами. Предложено использование алгоритма функционирования оптимальной системы управления для управления вращательным движением летательного аппарата.
Ключевые слова: система управления, вращательное движение твердого тела, модель Такаги–Сугено, нечеткая система управления.
Formation of optimal control of nonlinear dynamic object based on Takagi–Sugeno model
Computer Research and Modeling, 2015, v. 7, no. 1, pp. 51-59Views (last year): 2.The algorithm of fuzzy control system essentially nonlinear dynamic object is considered in this article. For solving nonlinear optimal control problem is proposed to use the method of linear quadratic regulation (LQR) with fuzzy Takagi–Sugeno model. The algorithm can be used for the design of deterministic optimal control of nonlinear objects. The algorithm of optimal control for controlling the rotational motion of a space vehicle is proposed.
Indexed in Scopus
Full-text version of the journal is also available on the web site of the scientific electronic library eLIBRARY.RU
The journal is included in the Russian Science Citation Index
The journal is included in the RSCI
International Interdisciplinary Conference "Mathematics. Computing. Education"




